Hallo!
Leider gibt es (meines Wissens) keine Einstellung, mit der Gnome den Mülleimer automatisch leert. Aber zumindest gibt es das Kommandozeilenprogramm empty-trash, mit dem man die ältesten Dateien aus dem Mülleimer entfernen kann.
Siehe: http://wiki.ubuntuusers.de/GNOME_Mülleimer
Installieren kann man das Programm z.B. per Aptitude:
sudo